Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP1Q7RTM1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP1Q7RTM1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms