Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SV2BQ7L1I2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SV2BQ7L1I2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms