Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM179Q6ZVK1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms