Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX8Q6ZV50 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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