Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HRCT1Q6UXD1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms