Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
C16orf54Q6UWD8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C16orf54Q6UWD8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms