Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TSSK4Q6SA08 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms