Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF6Q6KF10 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms