Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCTP1Q6DN14 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms