Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPECC1LQ69YQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms