Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LHX8Q68G74 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms