Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CREB3L3Q68CJ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms