Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF123Q5XPI4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF123Q5XPI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms