Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHEQ5VZ18 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHEQ5VZ18 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms