Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.26
CHIC1Q5VXU3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CHIC1Q5VXU3 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHIC1Q5VXU3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms