Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RSBN1Q5VWQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms