Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATRNL1Q5VV63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATRNL1Q5VV63 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms