Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIF1Q5UIP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIF1Q5UIP0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms