Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC18Q5T9S5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC18Q5T9S5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms