Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTC39AQ5SRH9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC39AQ5SRH9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms