Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNT1Q5JUK3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNT1Q5JUK3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms