Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITRM1Q5JRX3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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