Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR3Q5GH77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms