Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC178Q5BJE1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms