Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DCAF6Q58WW2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms