Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDRD12Q587J7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDRD12Q587J7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms