Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HSD17B12Q53GQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSD17B12Q53GQ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms