Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP55Q53EZ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms