Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DUSP28Q4G0W2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUSP28Q4G0W2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms