Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC142Q17RM4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC142Q17RM4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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