Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCK2Q16822 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCK2Q16822 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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