Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCSK7Q16549 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PCSK7Q16549 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCSK7Q16549 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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