Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms