Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E2F4Q16254 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E2F4Q16254 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms