Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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SNCBQ16143 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SNCBQ16143 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SNCBQ16143 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SNCBQ16143 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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SNCBQ16143 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNCBQ16143 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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