Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85BQ15834 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC85BQ15834 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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