Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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CYTH1Q15438 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CYTH1Q15438 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CYTH1Q15438 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CYTH1Q15438 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CYTH1Q15438 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CYTH1Q15438 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTH1Q15438 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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