Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTF1Q15361 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTF1Q15361 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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