Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IRF4Q15306 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms