Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NKX1-1Q15270 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NKX1-1Q15270 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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