Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB3GAP1Q15042 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB3GAP1Q15042 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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