Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNAB1Q14722 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNAB1Q14722 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNAB1Q14722 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNAB1Q14722 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNAB1Q14722 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNAB1Q14722 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms