Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSHL1Q14406 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms