Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERV3-1Q14264 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERV3-1Q14264 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms