Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTTNQ14247 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTTNQ14247 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms