Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SCARB2Q14108 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARB2Q14108 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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