Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLF9Q13886 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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