Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EXOSC2Q13868 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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