Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TUBA3CQ13748 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TUBA3CQ13748 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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