Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTCH1Q13635 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCH1Q13635 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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